Il percorso assoluto del dominio e':
/home/<TUOUTENTE>/domains/<TUODOMINIO>/public_html/

Quindi, inserendo un file dal nome test.php nella root (radice) del dominio, il suo percorso assoluto sarà:
/home/<TUOUTENTE>/domains/<TUODOMINIO>/public_html/test.php

Per i domini di Terzo Livello, il percorso assoluto è:
/home/<TUOUTENTE>/domains/<DOMINIOTERZOLIVELLO>/public_html/